Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abce1P61222 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abce1P61222 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms