Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2iP60898 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms