Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps5P59438 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps5P59438 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hps5P59438 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms