Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Senp1P59110 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Senp1P59110 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Senp1P59110 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms