Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CdaP56389 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CdaP56389 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CdaP56389 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CdaP56389 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CdaP56389 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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