Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms