Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn1swP51491 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Opn1swP51491 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms