Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl9P51410 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl9P51410 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms