Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FmodP50608 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FmodP50608 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FmodP50608 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FmodP50608 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FmodP50608 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FmodP50608 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FmodP50608 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms