Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CitP49025 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CitP49025 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CitP49025 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CitP49025 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CitP49025 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CitP49025 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CitP49025 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CitP49025 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CitP49025 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CitP49025 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CitP49025 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms