Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scg3P47867 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms