Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VtnP29788 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
VtnP29788 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VtnP29788 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VtnP29788 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VtnP29788 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VtnP29788 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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