Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casp1P29452 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms