Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrkcdP28867 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PrkcdP28867 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms