Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kif5cP28738 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kif5cP28738 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms