Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LoxP28301 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LoxP28301 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LoxP28301 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms