Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms