Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gjc1P28229 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gjc1P28229 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms