Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpbP27790 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms