Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd40lgP27548 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms