Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htr3aP23979 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htr3aP23979 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms