Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja1P23242 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gja1P23242 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms