Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Eif3aP23116 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms