Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms