Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcb1aP21447 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Abcb1aP21447 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms