Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NelfeP19426 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms