Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps6ka3P18654 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps6ka3P18654 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms