Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18528 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
P18528 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18528 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18528 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18528 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms