Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtpraP18052 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpraP18052 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpraP18052 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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