Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms