Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rag1P15919 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rag1P15919 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms