Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdh2P15116 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms