Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PolP11369 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PolP11369 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolP11369 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolP11369 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolP11369 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolP11369 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PolP11369 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PolP11369 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PolP11369 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms