Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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