Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms