Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Myod1P10085 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Myod1P10085 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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