Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms