Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb1P09055 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms