Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxa5P09021 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms