Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NeflP08551 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeflP08551 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NeflP08551 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NeflP08551 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NeflP08551 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NeflP08551 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NeflP08551 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NeflP08551 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NeflP08551 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NeflP08551 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms