Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TtrP07309 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TtrP07309 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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