Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TnfP06804 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TnfP06804 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TnfP06804 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TnfP06804 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TnfP06804 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TnfP06804 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms