Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms