Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms