Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfb1P04202 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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