Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01852 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01852 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01852 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01852 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01852 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01852 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01852 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01852 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01852 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01852 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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