Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
P01649 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P01649 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
P01649 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P01649 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms