Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AfmO89020 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AfmO89020 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AfmO89020 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AfmO89020 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
AfmO89020 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AfmO89020 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AfmO89020 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AfmO89020 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AfmO89020 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AfmO89020 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms