Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hcn2O88703 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms