Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnal1O88327 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnal1O88327 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms